El semillero de investigación de Biología Sintética fue inscrito el 19 de agosto de 2022 por Clara Isabel Bermúdez Santanda, Profesora Asociada del Departamento de Biología como una iniciativa inter-institucional que constituye un espacio colaborativo en el que estudiantes de diferentes disciplinas cuentan con el apoyo de profesores, interesados en el desarrollo de la biología sintética en la Universidad Nacional sede Bogotá
En el semillero de investigación estamos motivados por la convicción de que las asociaciones heterospecíficas (simbiosis) desafían nuestra concepción de la individualidad biológica y que la comprensión de los mecanismos moleculares que los subyacen tiene fuertes implicaciones para la innovación evolutiva y las aplicaciones en diversas industrias.
Dentro de cinco años, el semillero pretende ser capaz de realizar experimentos computacionales en modelos evolutivos que pueden representar conversiones de información y las ganancias de energía resultantes utilizables por entidades en evolución. Esto se puede lograr tanto a nivel de organismos virtuales como de proteínas naturales y ARN.
Actualmente tenemos 4 lineas de investigación, las cuales son las siguientes:
Análisis de la relación estructura-función en biología molecular desde la perspectiva de la continuidad organizacional a niveles jerárquicos
Evolución de regiones genómicas no codificantes
Identificación de los mecanismos moleculares subyacentes a las interacciones simbióticas
Diseño computacional de circuitos genéticos en microorganismos para modular la fisiología del huésped
Researchers: Angelica Millan Aldana, Maryam Chaib De Mares, Daniel Schindler (MPI Terrestrial Microbiology)
Vibrio natriegens is emerging as a potential host for biotechnology, mainly due to its remarkable intrinsic properties such as exceptional growth rates and versatile metabolites. Although recent studies have highlighted the potential of V. natriegens for biotechnological applications, a deeper understanding of its metabolism and regulation is needed to fully exploit its potential. This study focuses on characterising the metabolome and establishing growth conditions for V. natriegens in defined media.
Researchers: Julieth Camila Naranjo, Maryam Chaib De Mares
Tropane alkaloids (TAs) are essential compounds in medicine, used to treat various conditions. However, their current production through solanaceous plant cultivation faces significant limitations, such as the complexity and cost of chemical synthesis, dependence on agriculture, and negative environmental impact.
Researchers: Diego Enrique Carrillo Ruíz, Maryam Chaib De Mares, Daniel Fernando Rojas Tapias (Agrosavia)
The use of microbial consortia in the degradation of recalcitrant plant material has been proposed as a naturally occurring alternative to increasing the saccharification efficiency of lignocellulosic biomass. This work consists of characterizing the carbohydrate-active enzymes present in the feces of the porcupine Coendou vestitus, a herbivore whose diet is primarily plant-based.
